Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSRNP1Q96S65 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSRNP1Q96S65 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP1Q96S65 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP1Q96S65 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP1Q96S65 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSRNP1Q96S65 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms