Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pth2Q91W27 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pth2Q91W27 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms