Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs1Q8K212 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs1Q8K212 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs1Q8K212 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs1Q8K212 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs1Q8K212 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs1Q8K212 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs1Q8K212 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs1Q8K212 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs1Q8K212 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs1Q8K212 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms