Protein–RNA interactions for Protein: Q8BS39

Ccdc32, Coiled-coil domain-containing protein 32, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc32Q8BS39 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc32Q8BS39 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc32Q8BS39 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc32Q8BS39 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms