Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sys1Q78S06 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sys1Q78S06 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms