Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnna3Q65CL1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnna3Q65CL1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnna3Q65CL1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms