Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TraddQ3U0V2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TraddQ3U0V2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TraddQ3U0V2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TraddQ3U0V2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TraddQ3U0V2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.3 ms