Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ccdc136Q3TVA9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ccdc136Q3TVA9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ccdc136Q3TVA9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ccdc136Q3TVA9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms