Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 BUD22YMR014W 1560 nt5.03□□□□□ -1.6
AVL9Q12500 MIF2YKL089W 1650 nt5.02□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 PFA5YDR459C 1125 nt5.02□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 PEX12YMR026C 1200 nt5.02□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 MFA2YNL145W 117 nt5.02□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 ELA1YNL230C 1140 nt5.02□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 GCN20YFR009W 2259 nt5.02□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 HXT7YDR342C 1713 nt5.01□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 HXT6YDR343C 1713 nt5.01□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 LUC7YDL087C 786 nt5.01□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 ERV14YGL054C 417 nt5.01□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 NVJ1YHR195W 966 nt5.01□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 OAZ1YPL052W 879 nt5.01□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 NRG2YBR066C 663 nt5.01□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 UBP9YER098W 2265 nt5□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 ASA1YPR085C 1332 nt5□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 LDB18YLL049W 540 nt5□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 CUE5YOR042W 1236 nt5□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 PCL8YPL219W 1479 nt5□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 DEG1YFL001W 1329 nt4.99□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 TIP20YGL145W 2106 nt4.99□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 DAL81YIR023W 2913 nt4.99□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 LEU1YGL009C 2340 nt4.99□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 MOB2YFL034C-B 864 nt4.99□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt4.99□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 SMA1YPL027W 738 nt4.99□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 SSO1YPL232W 873 nt4.99□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 NHP6AYPR052C 282 nt4.99□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 snR34snR34 203 nt4.99□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 CDC28YBR160W 897 nt4.99□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 YCL012CYCL012C 405 nt4.99□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 TOS3YGL179C 1683 nt4.99□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 DSD1YGL196W 1287 nt4.98□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 TRS33YOR115C 807 nt4.98□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 TFG1YGR186W 2208 nt4.97□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 TUB2YFL037W 1374 nt4.97□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 YEL067CYEL067C 588 nt4.97□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 MSA2YKR077W 1092 nt4.97□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 RPS0BYLR048W 759 nt4.97□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 RPS31YLR167W 459 nt4.97□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 SNO1YMR095C 675 nt4.97□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 GRE1YPL223C 507 nt4.97□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 PAL1YDR348C 1500 nt4.97□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 FRE1YLR214W 2061 nt4.96□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 CDC4YFL009W 2340 nt4.96□□□□□ -1.61
AVL9Q12500 AIR2YDL175C 1035 nt4.96□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 UBC1YDR177W 648 nt4.96□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 ECT1YGR007W 972 nt4.96□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 YNG2YHR090C 849 nt4.96□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 TRM10YOL093W 882 nt4.96□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 CKB2YOR039W 777 nt4.96□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 CKS1YBR135W 453 nt4.96□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 YMR102CYMR102C 2505 nt4.96□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 ALG2YGL065C 1512 nt4.96□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 SER33YIL074C 1410 nt4.96□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 YOR1YGR281W 4434 nt4.95□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 EKI1YDR147W 1605 nt4.95□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 EDC1YGL222C 528 nt4.95□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 YGR273CYGR273C 525 nt4.95□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 HPM1YIL110W 1134 nt4.95□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 SFK1YKL051W 1062 nt4.95□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 PRM9YAR031W 897 nt4.95□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 YOL050CYOL050C 321 nt4.95□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 RMI1YPL024W 726 nt4.95□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 HSP26YBR072W 645 nt4.95□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 PHO90YJL198W 2646 nt4.94□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 HIR2YOR038C 2628 nt4.94□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 STP4YDL048C 1473 nt4.94□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 RAD57YDR004W 1383 nt4.94□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 NOP16YER002W 696 nt4.94□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 SCS2YER120W 735 nt4.94□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 ADD66YKL206C 804 nt4.94□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 YLR036CYLR036C 612 nt4.94□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 FES1YBR101C 873 nt4.94□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 HRR25YPL204W 1485 nt4.94□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 YHR177WYHR177W 1362 nt4.93□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 MED2YDL005C 1296 nt4.93□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 AUA1YFL010W-A 285 nt4.93□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 IMD3YLR432W 1572 nt4.93□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 YMR114CYMR114C 1107 nt4.93□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 YNL174WYNL174W 573 nt4.93□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 snR17bsnR17b 332 nt4.93□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 THI22YPR121W 1719 nt4.93□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 YHR182WYHR182W 2358 nt4.93□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 COT1YOR316C 1320 nt4.93□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 PAF1YBR279W 1338 nt4.93□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 YHP1YDR451C 1062 nt4.92□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 YGR153WYGR153W 654 nt4.92□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 YIL086CYIL086C 309 nt4.92□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 DOA1YKL213C 2148 nt4.92□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 ANT1YPR128C 987 nt4.92□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt4.92□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 GPR1YDL035C 2886 nt4.92□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 NOC4YPR144C 1659 nt4.92□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 YBR139WYBR139W 1527 nt4.92□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 FAA3YIL009W 2085 nt4.92□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 SKG3YLR187W 3081 nt4.91□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 SAS10YDL153C 1833 nt4.91□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 SEG2YKL105C 3399 nt4.91□□□□□ -1.62
AVL9Q12500 MRPL7YDR237W 879 nt4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms