Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 RCK2YLR248W 1833 nt4.45□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 SSB2YNL209W 1842 nt4.45□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 YGR122WYGR122W 1209 nt4.45□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 YGR291CYGR291C 222 nt4.45□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 SAP30YMR263W 606 nt4.45□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt4.45□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 SYP1YCR030C 2613 nt4.45□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 MRE11YMR224C 2079 nt4.45□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 CRT10YOL063C 2874 nt4.45□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 ATR1YML116W 1629 nt4.44□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 ARF2YDL137W 546 nt4.44□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 SUR2YDR297W 1050 nt4.44□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 ECM1YAL059W 639 nt4.44□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 RTC1YOL138C 4026 nt4.44□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 MNT2YGL257C 1677 nt4.44□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 TAF5YBR198C 2397 nt4.43□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 RAD28YDR030C 1521 nt4.43□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 AXL2YIL140W 2472 nt4.43□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 FMP48YGR052W 1110 nt4.43□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt4.43□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 YJL220WYJL220W 453 nt4.43□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 TOM40YMR203W 1164 nt4.43□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 OCA1YNL099C 717 nt4.43□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 UMP1YBR173C 447 nt4.43□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 HOT1YMR172W 2160 nt4.43□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.42□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 SNA2YDR525W-A 240 nt4.42□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 YLF2YHL014C 1218 nt4.42□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 OSW5YMR148W 447 nt4.42□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 YOR292CYOR292C 930 nt4.42□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 KRE6YPR159W 2163 nt4.42□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 AKL1YBR059C 3327 nt4.42□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 PCL8YPL219W 1479 nt4.42□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 ALG2YGL065C 1512 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 MET3YJR010W 1536 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 ABF1YKL112W 2196 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 MPS3YJL019W 2049 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 APC1YNL172W 5247 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 HNT2YDR305C 654 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 RPL34AYER056C-A 366 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 GLE2YER107C 1098 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 TOM20YGR082W 552 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 DCD1YHR144C 939 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 RSA3YLR221C 663 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 GTR1YML121W 933 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 SMA1YPL027W 738 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 ALG6YOR002W 1635 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 MMR1YLR190W 1476 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 FAA4YMR246W 2085 nt4.41□□□□□ -1.7
RRP42Q12277 RAM1YDL090C 1296 nt4.4□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YKR104WYKR104W 921 nt4.4□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 NMA1YLR328W 1206 nt4.4□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 SPS18YNL204C 903 nt4.4□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YOL035CYOL035C 303 nt4.4□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 ESF1YDR365C 1887 nt4.4□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 TFC7YOR110W 1308 nt4.4□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 SUM1YDR310C 3189 nt4.4□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 TSL1YML100W 3297 nt4.4□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 TFG1YGR186W 2208 nt4.4□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 ARP10YDR106W 855 nt4.39□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 ARG82YDR173C 1068 nt4.39□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 HSP31YDR533C 714 nt4.39□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 COA3YJL062W-A 258 nt4.39□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 FMP33YJL161W 543 nt4.39□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 BUD17YNR027W 954 nt4.39□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 EUG1YDR518W 1554 nt4.39□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 UBP7YIL156W 3216 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 HRK1YOR267C 2280 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 NOP58YOR310C 1536 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YDL012CYDL012C 324 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 PAD1YDR538W 729 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 RIP1YEL024W 648 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YIL028WYIL028W 399 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YIR043CYIR043C 693 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 PAU17YLL025W 375 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YNL134CYNL134C 1131 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YGP1YNL160W 1065 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 MRP21YBL090W 534 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 CIN5YOR028C 888 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YPL113CYPL113C 1191 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 SAC1YKL212W 1872 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 MSC2YDR205W 2175 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 WTM1YOR230W 1314 nt4.38□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 CLA4YNL298W 2529 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 LEU1YGL009C 2340 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YEL045CYEL045C 426 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YFL068WYFL068W 483 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YHL049CYHL049C 816 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.37□□□□□ -1.71
RRP42Q12277 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.8 ms