Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 HIR2YOR038C 2628 nt4.54□□□□□ -1.68
VAM3Q12241 HRK1YOR267C 2280 nt4.53□□□□□ -1.68
VAM3Q12241 ZUO1YGR285C 1302 nt4.53□□□□□ -1.68
VAM3Q12241 TCM62YBR044C 1719 nt4.53□□□□□ -1.68
VAM3Q12241 MCM21YDR318W 1107 nt4.53□□□□□ -1.68
VAM3Q12241 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.53□□□□□ -1.68
VAM3Q12241 ARD1YHR013C 717 nt4.53□□□□□ -1.68
VAM3Q12241 FMP33YJL161W 543 nt4.53□□□□□ -1.68
VAM3Q12241 KCC4YCL024W 3114 nt4.53□□□□□ -1.68
VAM3Q12241 MGS1YNL218W 1764 nt4.53□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 OCT1YKL134C 2319 nt4.52□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 SAC1YKL212W 1872 nt4.52□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 VHC1YBR235W 3363 nt4.52□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YDL034WYDL034W 345 nt4.52□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 KNH1YDL049C 807 nt4.52□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 GIR2YDR152W 798 nt4.52□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 SYF2YGR129W 648 nt4.52□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YLF2YHL014C 1218 nt4.52□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 DCN1YLR128W 810 nt4.52□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YIM2YMR151W 438 nt4.52□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 TPP1YMR156C 717 nt4.52□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 DAL82YNL314W 768 nt4.52□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YOR200WYOR200W 399 nt4.52□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 ISU2YOR226C 471 nt4.52□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 ALG2YGL065C 1512 nt4.51□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 ALD3YMR169C 1521 nt4.51□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 ALD2YMR170C 1521 nt4.51□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YHR045WYHR045W 1683 nt4.51□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 CTS1YLR286C 1689 nt4.51□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 APM2YHL019C 1818 nt4.51□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 HFA1YMR207C 6372 nt4.51□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 SCW4YGR279C 1161 nt4.51□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 PGU1YJR153W 1086 nt4.51□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YLR326WYLR326W 723 nt4.51□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YMR114CYMR114C 1107 nt4.51□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 GSP2YOR185C 663 nt4.51□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 BSD2YBR290W 966 nt4.51□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 MLF3YNL074C 1359 nt4.51□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 RTT106YNL206C 1368 nt4.51□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 CUE2YKL090W 1332 nt4.5□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YDL172CYDL172C 480 nt4.5□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 AAD4YDL243C 990 nt4.5□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 SPR28YDR218C 1272 nt4.5□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 COS9YKL219W 1224 nt4.5□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.5□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.5□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 MCH4YOL119C 1506 nt4.5□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 CTT1YGR088W 1689 nt4.49□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 COS7YDL248W 1152 nt4.49□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 GCV1YDR019C 1203 nt4.49□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 CAB1YDR531W 1104 nt4.49□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YGL101WYGL101W 648 nt4.49□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 COS5YJR161C 1152 nt4.49□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 MTC2YKL098W 1074 nt4.49□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 ROX3YBL093C 663 nt4.49□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 SFT2YBL102W 648 nt4.49□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 TGS1YPL157W 948 nt4.49□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.49□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 KTR7YIL085C 1554 nt4.48□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 VID30YGL227W 2877 nt4.48□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 RKM2YDR198C 1440 nt4.48□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 ERD1YDR414C 1089 nt4.48□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YGR015CYGR015C 987 nt4.48□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 PRP45YAL032C 1140 nt4.48□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 REX3YLR107W 1215 nt4.48□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt4.48□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 VPS28YPL065W 729 nt4.48□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 CBC2YPL178W 627 nt4.48□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 ATG14YBR128C 1035 nt4.48□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YHL012WYHL012W 1482 nt4.48□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 TOS4YLR183C 1470 nt4.48□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 ATG20YDL113C 1923 nt4.48□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 RNY1YPL123C 1305 nt4.47□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 PHO12YHR215W 1404 nt4.47□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 PHO11YAR071W 1404 nt4.47□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 TGL1YKL140W 1647 nt4.47□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 HUL4YJR036C 2679 nt4.47□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 PHO92YDR374C 921 nt4.47□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YHP1YDR451C 1062 nt4.47□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YPL114WYPL114W 420 nt4.47□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 LAP3YNL239W 1365 nt4.47□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 MDL1YLR188W 2088 nt4.47□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YER137C-AYER137C-A 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YER159C-AYER159C-A 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YJR026WYJR026W 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YJR028WYJR028W 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YAR010CYAR010C 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YML040WYML040W 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
VAM3Q12241 YML045W-AYML045W-A 1323 nt4.46□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.2 ms