Protein–RNA interactions for Protein: Q06702

CDA1, Chitin deacetylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDA1Q06702 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YER137C-AYER137C-A 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YER159C-AYER159C-A 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YJR026WYJR026W 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YJR028WYJR028W 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YAR010CYAR010C 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YML040WYML040W 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YML045W-AYML045W-A 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YMR051CYMR051C 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 TKL1YPR074C 2043 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 PHO12YHR215W 1404 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 PHO11YAR071W 1404 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 SLM5YCR024C 1479 nt5.63□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 MKC7YDR144C 1791 nt5.62□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 BUD30YDL151C 582 nt5.62□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 PLP1YDR183W 693 nt5.62□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YER010CYER010C 705 nt5.62□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 SIP2YGL208W 1248 nt5.62□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YGR219WYGR219W 342 nt5.62□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 HOT13YKL084W 351 nt5.62□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YLR317WYLR317W 435 nt5.62□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 VMA6YLR447C 1038 nt5.62□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 MDM12YOL009C 816 nt5.62□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 ATG14YBR128C 1035 nt5.62□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 ADE12YNL220W 1302 nt5.62□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 EMW1YNL313C 2715 nt5.62□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.62□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YIR007WYIR007W 2295 nt5.62□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 STE13YOR219C 2796 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 LDB17YDL146W 1476 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 UTP7YER082C 1665 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YGL230CYGL230C 444 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 SFC1YJR095W 969 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 APN1YKL114C 1104 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YKR047WYKR047W 306 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 SSK1YLR006C 2139 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 RFA1YAR007C 1866 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 GAS2YLR343W 1668 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YLR374CYLR374C 390 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 RPS10BYMR230W 318 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 NPT1YOR209C 1290 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 SPS4YOR313C 1017 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 STE50YCL032W 1041 nt5.61□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YME1YPR024W 2244 nt5.6□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 CHL4YDR254W 1377 nt5.6□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 GRE3YHR104W 984 nt5.6□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.6□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 NRG2YBR066C 663 nt5.6□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 SCT1YBL011W 2280 nt5.59□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 MEK1YOR351C 1494 nt5.59□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 MSS2YDL107W 1056 nt5.59□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 APS3YJL024C 585 nt5.59□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 GON7YJL184W 372 nt5.59□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 CBF1YJR060W 1056 nt5.59□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 PER33YLR064W 822 nt5.59□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 COS3YML132W 1140 nt5.59□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 YBR013CYBR013C 390 nt5.59□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 MRPS5YBR251W 924 nt5.59□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 COS2YBR302C 1140 nt5.59□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 VTC2YFL004W 2487 nt5.59□□□□□ -1.51
CDA1Q06702 GPM2YDL021W 936 nt5.58□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 YFR057WYFR057W 456 nt5.58□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 YIL152WYIL152W 708 nt5.58□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 YLR049CYLR049C 1287 nt5.58□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.58□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 RHO2YNL090W 579 nt5.58□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 RPL3YOR063W 1164 nt5.58□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 MLC2YPR188C 492 nt5.58□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 AMD1YML035C 2433 nt5.58□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 PRI2YKL045W 1587 nt5.58□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 SRP101YDR292C 1866 nt5.58□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 SNZ3YFL059W 897 nt5.57□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt5.57□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt5.57□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 PSF2YJL072C 642 nt5.57□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 RHO4YKR055W 876 nt5.57□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.57□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 SNZ2YNL333W 897 nt5.57□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 ATP20YPR020W 348 nt5.57□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 YBR124WYBR124W 360 nt5.57□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 YBR144CYBR144C 315 nt5.57□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 CDC19YAL038W 1503 nt5.57□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 RNY1YPL123C 1305 nt5.56□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 YDL183CYDL183C 963 nt5.56□□□□□ -1.52
CDA1Q06702 MNN10YDR245W 1182 nt5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49 ms