Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP7AQ04656 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP7AQ04656 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms