Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nkx2-3P97334 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nkx2-3P97334 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nkx2-3P97334 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx2-3P97334 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx2-3P97334 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx2-3P97334 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx2-3P97334 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx2-3P97334 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx2-3P97334 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms