Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl30P62889 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl30P62889 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl30P62889 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms