Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr2fP61219 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Polr2fP61219 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr2fP61219 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms