Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppfia3P60469 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfia3P60469 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms