Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa6P50704 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa6P50704 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa6P50704 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa6P50704 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa6P50704 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa6P50704 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa6P50704 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa6P50704 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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