Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Traf1P39428 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Traf1P39428 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf1P39428 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf1P39428 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf1P39428 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Traf1P39428 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms