Protein–RNA interactions for Protein: P38915

SPT8, Transcription factor SPT8, yeastyeast

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT8P38915 HSP82YPL240C 2130 nt5.03□□□□□ -1.6
SPT8P38915 CAB1YDR531W 1104 nt5.03□□□□□ -1.6
SPT8P38915 PAU17YLL025W 375 nt5.03□□□□□ -1.6
SPT8P38915 YMR082CYMR082C 357 nt5.03□□□□□ -1.6
SPT8P38915 SAP30YMR263W 606 nt5.03□□□□□ -1.6
SPT8P38915 TGS1YPL157W 948 nt5.03□□□□□ -1.6
SPT8P38915 ATR1YML116W 1629 nt5.03□□□□□ -1.6
SPT8P38915 CBP1YJL209W 1965 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT8P38915 TFB3YDR460W 966 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT8P38915 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YJL215CYJL215C 360 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT8P38915 MRPL39YML009C 213 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT8P38915 PMT5YDL093W 2232 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT8P38915 SWI3YJL176C 2478 nt5.02□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YDL124WYDL124W 939 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT8P38915 NVJ1YHR195W 966 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YLR125WYLR125W 411 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT8P38915 MED4YOR174W 855 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT8P38915 ARC40YBR234C 1155 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YBR139WYBR139W 1527 nt5.01□□□□□ -1.61
SPT8P38915 ZPR1YGR211W 1461 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 TEL1YBL088C 8364 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 GPR1YDL035C 2886 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YER190C-BYER190C-B 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YFL068WYFL068W 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YGR269WYGR269W 327 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 GPP1YIL053W 753 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 FMP33YJL161W 543 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YKL169CYKL169C 384 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YML133W-BYML133W-B 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YNR042WYNR042W 429 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 GAL4YPL248C 2646 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 MRE11YMR224C 2079 nt5□□□□□ -1.61
SPT8P38915 AKL1YBR059C 3327 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 ARF2YDL137W 546 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 ARG82YDR173C 1068 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 SNA2YDR525W-A 240 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 RIP1YEL024W 648 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 TYW3YGL050W 822 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 ARC1YGL105W 1131 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 ECM15YBL001C 315 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 NMA1YLR328W 1206 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YIF1YNL263C 945 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YNL296WYNL296W 315 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 RMI1YPL024W 726 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 UMP1YBR173C 447 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 AIM10YER087W 1731 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 HOT1YMR172W 2160 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 HRK1YOR267C 2280 nt4.99□□□□□ -1.61
SPT8P38915 ORC6YHR118C 1308 nt4.98□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YER158CYER158C 1722 nt4.98□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.98□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YDL027CYDL027C 1263 nt4.98□□□□□ -1.61
SPT8P38915 KIN28YDL108W 921 nt4.98□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YHL049CYHL049C 816 nt4.98□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YJR012CYJR012C 624 nt4.98□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YPL113CYPL113C 1191 nt4.98□□□□□ -1.61
SPT8P38915 ATG14YBR128C 1035 nt4.98□□□□□ -1.61
SPT8P38915 SAC1YKL212W 1872 nt4.98□□□□□ -1.61
SPT8P38915 THI20YOL055C 1656 nt4.97□□□□□ -1.61
SPT8P38915 YGR066CYGR066C 879 nt4.97□□□□□ -1.61
SPT8P38915 NTR2YKR022C 969 nt4.97□□□□□ -1.61
SPT8P38915 SEG2YKL105C 3399 nt4.96□□□□□ -1.61
SPT8P38915 LEU1YGL009C 2340 nt4.96□□□□□ -1.61
SPT8P38915 LYS2YBR115C 4179 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 PAH1YMR165C 2589 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 RTT103YDR289C 1230 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 JAC1YGL018C 555 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 LYS5YGL154C 819 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 YGR016WYGR016W 573 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 GTR1YML121W 933 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 TOM40YMR203W 1164 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 BUD17YNR027W 954 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 ARG8YOL140W 1272 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 YOR292CYOR292C 930 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 ABF1YKL112W 2196 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 MSE1YOL033W 1611 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 VBA2YBR293W 1425 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 EAR1YMR171C 1653 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 IFM1YOL023W 2031 nt4.96□□□□□ -1.62
SPT8P38915 LPL1YOR059C 1353 nt4.95□□□□□ -1.62
SPT8P38915 NUP116YMR047C 3342 nt4.95□□□□□ -1.62
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