Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
POLR1AO95602 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
POLR1AO95602 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
POLR1AO95602 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POLR1AO95602 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms