Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm10509O88255 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm10509O88255 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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