Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
KIAA0556O60303 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KIAA0556O60303 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms