Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn4O35054 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn4O35054 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cldn4O35054 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cldn4O35054 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
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