Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LINC01565O15544 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINC01565O15544 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC01565O15544 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms