Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Degs1O09005 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Degs1O09005 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Degs1O09005 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Degs1O09005 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Degs1O09005 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms