Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
O00370 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
O00370 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
O00370 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
O00370 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
O00370 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
O00370 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
O00370 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
O00370 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
O00370 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
O00370 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
O00370 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
O00370 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
O00370 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
O00370 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
O00370 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
O00370 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
O00370 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
O00370 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
O00370 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
O00370 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
O00370 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
O00370 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
O00370 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
O00370 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
O00370 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
O00370 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
O00370 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
O00370 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
O00370 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
O00370 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
O00370 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
O00370 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
O00370 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
O00370 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
O00370 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
O00370 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
O00370 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
O00370 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
O00370 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
O00370 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
O00370 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
O00370 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
O00370 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
O00370 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
O00370 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
O00370 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
O00370 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
O00370 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
O00370 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
O00370 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
O00370 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
O00370 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
O00370 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
O00370 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
O00370 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
O00370 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
O00370 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
O00370 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
O00370 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
O00370 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
O00370 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
O00370 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
O00370 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
O00370 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
O00370 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
O00370 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
O00370 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
O00370 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
O00370 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
O00370 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
O00370 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
O00370 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
O00370 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
O00370 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
O00370 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
O00370 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
O00370 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
O00370 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
O00370 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
O00370 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
O00370 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
O00370 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
O00370 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
O00370 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms