Protein–RNA interactions for Protein: F6ZR08

Gm15056, Predicted gene 15056, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15056F6ZR08 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm15056F6ZR08 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm15056F6ZR08 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm15056F6ZR08 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm15056F6ZR08 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm15056F6ZR08 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm15056F6ZR08 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm15056F6ZR08 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm15056F6ZR08 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm15056F6ZR08 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm15056F6ZR08 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm15056F6ZR08 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm15056F6ZR08 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm15056F6ZR08 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm15056F6ZR08 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm15056F6ZR08 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm15056F6ZR08 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm15056F6ZR08 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms