Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifit3bE9PV48 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifit3bE9PV48 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifit3bE9PV48 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifit3bE9PV48 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifit3bE9PV48 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifit3bE9PV48 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifit3bE9PV48 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifit3bE9PV48 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifit3bE9PV48 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifit3bE9PV48 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifit3bE9PV48 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ifit3bE9PV48 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ifit3bE9PV48 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ifit3bE9PV48 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifit3bE9PV48 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifit3bE9PV48 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms