Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP17L18D6R9N7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP17L18D6R9N7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms