Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vpreb3D3Z6J4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms