Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apol6B7ZC55 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apol6B7ZC55 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apol6B7ZC55 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms