Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik3B1AS29 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik3B1AS29 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik3B1AS29 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms