Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SSX1Q16384 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms