Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms