Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms