Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm14862-201ENSMUST00000115553 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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