Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB5-201ENST00000259037 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC112907.1-201ENST00000434957 540 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 BNC2-207ENST00000471301 745 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021006.2-201ENST00000526978 859 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049870.2-201ENST00000554389 693 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPN3-219ENST00000569136 1029 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031587.3-201ENST00000609976 814 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP9-3Q9BYQ3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms