Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FRMD7Q6ZUT3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms