Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED6P86452 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED6P86452 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED6P86452 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED6P86452 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED6P86452 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED6P86452 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED6P86452 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED6P86452 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED6P86452 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED6P86452 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED6P86452 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZBED6P86452 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms