Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BRCA2P51587 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms