Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm5538W4VSP6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm5538W4VSP6 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm5538W4VSP6 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm5538W4VSP6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm5538W4VSP6 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm5538W4VSP6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm5538W4VSP6 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm5538W4VSP6 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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