Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lgr5Q9Z1P4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lgr5Q9Z1P4 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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