Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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