Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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VAPAQ9P0L0 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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VAPAQ9P0L0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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VAPAQ9P0L0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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VAPAQ9P0L0 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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VAPAQ9P0L0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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VAPAQ9P0L0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VAPAQ9P0L0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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