Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rpl39lQ9CQD0 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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