Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms