Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AP000842.1-201ENST00000524467 698 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 RPL23AP49-202ENST00000638439 1138 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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MKRN4PQ13434 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 DUSP19-201ENST00000342619 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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MKRN4PQ13434 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 OR2A42-201ENST00000391496 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 OR2A1-201ENST00000408951 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 HNF4GP1-201ENST00000430567 1249 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AL590408.1-201ENST00000430905 453 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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