Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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HECTD4Q9Y4D8 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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HECTD4Q9Y4D8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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HECTD4Q9Y4D8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
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HECTD4Q9Y4D8 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
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HECTD4Q9Y4D8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
HECTD4Q9Y4D8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
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