Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLIP4Q8N3C7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLIP4Q8N3C7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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